Organograma
Em seu organograma atual, a Progepe conta com dois departamentos, sendo o Departamento de Administração de Pessoas (DAP) responsável por coordenar e executar as operações de processamento da folha de pagamento dos servidores e o Departamento de Normas e Seleção de Pessoas (DNSP) responsável por orientar a aplicação da legislação referente à gestão de pessoas, bem como acompanhar os concursos públicos e processos seletivos para contratação de pessoal no âmbito da Univasf.
Além dos dois departamentos, a Progepe conta com a Secretaria Administrativa (SA) responsável por prestar assessoria direta à Pró-Reitoria, emitir portarias e dar publicidade aos atos oficiais da Progepe e a Coordenação de Capacitação e Desempenho (CCD) responsável por planejar e executar o Plano de Desenvolvimento de Pessoas - PDP da Univasf, bem como gerir o Programa de Avaliação de Desempenho - PROAD e analisar as concessões das progressões e incentivos dos técnico-administrativos.